Cre重組酶,是來源于大腸桿菌噬菌體P1的一種類型I的拓樸異構酶(Type I topoisomerase), 也是一種酪氨酸重組酶(tyrosine recombinase。
LoxP位點,是位于P1噬菌體中的34bp序列,由兩個13bp的反向回文序列和8bp的中間間隔序列共同組成,間隔序列決定loxP的方向,loxP 位點的序列如下所示:
13bp 8bp 13bp
ATAACTTCGTATA-NNNTANNN-TATACGAAGTTAT
Cre重組酶不僅具有催化活性,而且與限制酶相似,能識別特異的DNA序列,即loxP位點,使兩個loxP位點間發生基因重組。Cre重組酶無需借助任何輔助因子,可作用于多種結構的DNA底物,如線形、環狀甚至超螺旋DNA。
由于Cre/loxP系統作用方式高效簡單,Cre/LoxP定位重組系統已在特定基因的刪除、基因功能的鑒定、外源基因的整合、基因捕獲及染色體工程等方面得到了有效的應用。